為加強Webmail服務之安全防護，資訊處訂於107年1月3日推出雙驗證機制，開啟雙驗證功能後，每次登入Webmail時，需透過行動裝置連網取得6位數字驗證碼，正確輸入帳號、通行碼及驗證碼後，才可開始使用Webmail服務，並於109年新增＠Google Authenticator雙驗證機制，適用於行動裝置無法上網的情況使用，使用者可自由切換選擇想要使用的驗證方式。
差異說明：
| 雙驗證方式 | 優點 | 缺點 |
| @Mail2000 | 使用@Mail2000 APP登入時，系統自動填入驗證碼 |
行動裝置需上網 |
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@Google Authenticator |
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使用@Mail2000 APP時，需手動填入驗證碼 |
使用方式：下列提供兩種雙驗證管道，您可以擇一使用。
一、@Mail2000雙驗證：(點此下載手冊)
- 行動裝置下載安裝@Mail2000 APP，完成帳號設定並開啟「雙重認證」功能。
- 登入Webmail，於「個人設定」選單中，點選「個人化設定」開啟「使用環境」之「雙重認證」「開啟＠Mail2000」功能。
- 確定後重新登入Webmail即可。
二、＠Google Authenticator雙驗證：請依線上教學進行設定
https://www.mailcloud.com.tw/news/1506newotp/otp_googleauth.html
- 行動裝置下載安裝Google Authenticator APP
- 登入Webmail，於「個人設定」選單中，點選「個人化設定」開啟「使用環境」之「雙重認證」「開啟Google Authenticator」功能。
- 開啟Google Authenticator APP，新增帳號並點選「掃描條碼」，產生6位數驗證碼。欲使用多裝置時，可掃描同組條碼。
- 重新登入Webmail即可。
取消方式：詳細設定方式請參閱操作說明。
一、@Mail2000雙驗證：
- 登入Webmail，於「個人設定」選單中，點選「個人化設定」關閉「使用環境」之「雙重認證」功能。
- 開啟行動裝置@Mail2000 APP帳號設定頁面，關閉「雙重認證」功能。
二、＠Google Authenticator雙驗證：
- 登入Webmail，於「個人設定」選單中，點選「個人化設定」關閉「使用環境」之「雙重認證」功能。
- 移除Google Authenticator APP的驗證碼。
更換行動裝置步驟：
- 取消舊裝置(步驟請參閱「取消方式」)。
- 註冊新裝置(步驟請參閱「使用方式」)。
使用限制：
一、@Mail2000雙驗證：
- 一個帳號限定註冊一台行動裝置。
- 僅支援Webmail與@Mail2000 APP服務，不支援其他郵件軟體。
二、＠Google Authenticator雙驗證：
- 行動裝置的時間需設定正確。
- 使用@Mail2000 APP時，需手動輸入或複製貼上驗證碼。
強化帳號安全(關閉其他服務)：
如您僅使用Webmail服務，無需使用smtp、pop3或imap等收發信件，建議至Webmail「個人設定」>「信箱安全」>「收發信服務」將smtp、pop3或imap關閉。
障礙申告：
常見問題以外問題，請帳號使用人填寫本處電子服務單（http://8855.sinica.edu.tw/）洽詢。